يعتبر مركز جراحة المسالك البولية و زراعة الكلى في المستشفى من المراكز الرائدة على مستوى المنطقة في تقديم الخدمات العلاجية المتطورة وذلك لوجود نخبة من الأطباء الاستشاريين المشهود لهم على مستوى المنطقة والعالم ذوو الخبرة العالية و المعرفة الواسعة في هذا الإختصاص، ويوفر المستشفى أحدث الأجهزة التشخيصية والعلاجية التي تواكب أحدث الأساليب العلمية في جراحة المسالك.
تجرى يوميا في هذا القسم العديد من العمليات الجراحية بأيدي أمهر الإستشاريين وبأحدث الطرق العلمية ضمن المجالات التالية ذكراً وليس حصراً:
1- حصوات الكلى والحالب والمثانة: حيث يتوفر في قسم جراحة المسالك البولية أحدث مناظير الجهاز البولى التي تعمل بشكل آمن داخل الجهاز البولي وصولا لحجرات الكلية وتعمل على إزالة الحصى مهما كان موقعها عن طريق تفتيت الحصوة.
2- عمليات تضخم البروستاتا: عن طريق استئصال البروستاتا بالمنظار دون الحاجة للجراحة.
3- عمليات استئصال الكلى: إن تم تشخيص مرض يستدعي إزالة الكلية مثل تعطل وظيفة الكلية الناتجة عن الارتداد المزمن أو الالتهابات المتكرر بتم إزالة هذه الكلية بسهولة وأمان.
4- جراحة أورام المسالك البولية والكلى.
5- عمليات ترميم المسالك البولية كإصلاح حوض الكلية وترميم الحالب، والمثانة بعد الإصابات.
6- عمليات دوالي الخصية الجراحية أو بالمنظار وعمليات فك التواء وتثبيت الخصية.
7- وحدة تفتيت الحصوات المزودة بجهاز لتفتيت الحصوات بتقنية الموجات الصادمة لتفتيت الحصى، والتى تتميز بنسب تفتيت عالية للحصى و يشرف على الوحدة أمهر الفنيين المتخصصين بتفتيت الحصى.